タンパク質の立体構造の解明はペルツ、ケンドリューらによるミオグロビン、ヘモグロビンといったタンパク質の解析を皮切りに、現在では構造生物学という分野を形成し発展してきた。そしてヒトゲノム計画に引き続き、｢タンパク3000｣をはじめとする構造ゲノムプロジェクトが世界的に進められてきた。その結果、タンパク質の立体構造を登録する公共データベースであるPDB(Protein Data Bank)への登録数は現在では6万件を超えている。類似構造や分解能の違いなど、構造情報の重複を考えてもかなりの立体構造情報の蓄積だと考えることができる。しかしながら、構造ゲノムプロジェクトによって積み上げられてきた立体構造情報は、タンパク質の基本フォールドの解析や構造解析技術の高度化という意味合いもあり、必ずしもすべてが立体構造情報の社会への還元(病気のメカニズムの解明、治療、創薬など)を目指したものではなかったと思われる。我々は「医工学」として、医学的に重要なタンパク質に注目しつつ「化学」という切り口でタンパク質を解析し、将来的に病気のメカニズムの解明や創薬につながるような研究を目指している。

タンパク質や核酸といった生体高分子は、生体中において特異的な分子認識機構を通して正確に機能している。分子の立体構造はそのような機能を果たす上で極めて重要な因子である。我々は医学的に注目されているタンパク質のうち、細胞内シグナル伝達関連、転写因子、膜タンパク質といったものの機能をその立体構造を通して理解することを目的としている。特にそのような生体分子を“超分子複合体”として、他の分子との相互作用そして生体システム中での位置づけを考慮しながら機能を議論したいと考えている。

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